宁夏哈巴湖国家级自然保护区位于宁夏盐池县中北部，处于陕西、甘肃、宁夏、内蒙古四省区交界，黄土高原向鄂尔多斯台地过渡、半干旱区向干旱区过渡、干草原向荒漠草原过渡、农区向牧区过渡的交错地带。自然地理位置十分独特和重要，历来是我国自然学者、经济学者、社会学者研究与关注的热点地区。 
 
    地理位置介于东径106°53′－107°40′，北纬37°37′-38°03′，总面积8.4万公顷。属荒漠-湿地生态系统类型的自然保护区。

    哈巴湖国家级自然保护区地处鄂尔多斯台地西缘，在祁连山、吕梁山、贺兰山的山字形构造的脊柱部位的布伦庙－镇原白垩系大向斜和贺兰山－青龙山褶皱带内。保护区地势南高北低，海拔1300-1622米，由黄土侵蚀高坡丘陵、缓坡丘陵、平坦洼地、河流冲沟、沙漠丘陵等地貌单元组成，沙漠丘陵为主要地貌类型之一。地带性土壤主要有灰钙土，非地带性土壤主要有风沙土、潮土、盐土、新积土、堆垫土等类型。

    保护区境内无大河流，均为内陆冲沟水系，地表水以大气降水和泉水补给。保护区内流域面积大于300公顷的河沟有22条。地下水主要有毛乌素沙地第四系地下水，毛乌素沙地基岩地下水以及承压自流水和南部黄土区地下水。地下水从南向北埋藏渐浅，水量逐渐增多，水质逐渐变好，其含水量、面积、富含水地区占盐池县地下水资源总量的80%以上。湿地总面积2.16万公顷，占保护区总面积的25.7%。主要类型有湖泊型湿地和沼泽型湿地。

    保护区处于中温带大陆性季风气候区，气候特征是冬寒长，夏热短，春迟秋早；太阳辐射强烈，日照资源充足；热量较为丰富，昼夜温差大；降水量少，持续干旱时间长；盛行西风，春季为多风季节；空气湿度小，蒸发量大；无霜期短，土壤冻结时间长。年均气温7.1℃，最高气温37.0℃，最低气温-29.5℃，年均≥10℃的积温3081.2℃，年均日照2852.9小时，平均无霜期128天，年均降雨量285毫米，全年降水量80％多集中在7－9月份，年均蒸发量2727.4毫米，是全年降水量的9.6倍；年均风速2.7米/秒，大风日数为45.8天，多集中在11月至翌年4月间，最多达52天，最大风速达15-18米/秒，年平均沙暴日数20.6天，以春季最多；灾害天气主要有干旱、霜冻、冰雹、风、沙暴、干热风等。

    保护区植被区划属于温带草原区、温带东部草原亚区、草原地带。天然植被分为灌丛、草甸、干草原、荒漠草原、草原带沙生植被、荒漠、水生植被、沼泽及河漫滩植被等7个植被型13个植被亚型25个群系。有野生维管束植物315种，分属于54科169属，有国家重点保护植物中麻黄、草麻黄、甘草、沙冬青、沙棘、沙芦草等6种。中草药资源极为丰富，是驰名中外的"甘草之乡"。野生植物中旱生、中旱生、强旱生植物有189种，占总种数的60％，具有较强的荒漠草原特征。由于保护区地处四大过渡带的交错区，植被的过渡性十分明显，典型黄土高原草原植物，典型荒漠草原植物，典型的毛乌素沙地沙生草原植物，非地带性的盐地灌丛和湿地草甸植物交错分布，表现为过渡地带植物相互交汇渗透的特征。